علی مطهری در گفت‌وگو با خبرنگار سیاسی خبرگزاری موج درباره تاثیر رئیس‌جمهور جدید بر تغییر سیاست‌های منطقه‌ای جمهوری اسلامی ایران گفت: حمایت از فلسطین جزء اصول جمهوری اسلامی است و بحث آزادی فلسطین چیزی نیست که یک رئیس‌جمهور بتواند آن را تغییر دهد. ممکن است در اعمال این سیاست با تدبیر بیشتری عمل کند، ولی اصل آن ثابت است.

وی درباره احترام به آزادی‌های مردم از سوی رئیس‌جمهور تصریح کرد: در اینجا منظور آزادی بیان است. حال بعضی‌ها این را به آزادی پوشش هم ارتباط می‌دهند. ولی این نمی‌شود. بالاخره جمهوری اسلامی یک حکومت اسلامی است. اما نوع نظارتی که بر آن می‌شود مهم است که سختگیری بی‌جا وجود نداشته باشد. ولی در یک حدی مردم باید رعایت کنند. 

نماینده سابق مجلس در خصوص تغییر رئیس‌جمهور بر نحوه برخورد با منتقدان و معترضان بیان کرد: تغییر رئیس‌جمهور می تواند روی این موضوعات اثرگذار باشد، زیرا رئیس‌جمهور مسئول اجرای قانون اساسی است. در این مواقع می تواند اخطار بدهد حتی به قوه قضائیه. اگر کسی را بی‌جا بازداشت کنند و رئیس‌جمهور اعتراض کند و حتی به وزارت اطلاعات و قوه قضائیه اخطار بدهد، در سطح جامعه موثر است و طرف مقابل را در کارهایی که می‌کند، سست خواهد کرد.