متن پیام محمدرضا عارف،  معاون اول رئیس جمهور ​ به شرح زیر است :

انالله و اناالیه راجعون

درگذشت اندوه‌بار خیر نیک‌نام، انسان فرهیخته و چهره‌ ماندگار خدمت، شادروان دکتر ناصر قفلی، موجب تأسف و تأثر فراوان شد.

آن انسان والامقام که سالیان دراز، با نیت پاک و همت بلند، در راه گسترش دانایی و ساختن آینده‌ای روشن برای فرزندان این سرزمین کوشید، بی‌گمان نام نیک و یادگارهای ارزشمندش در حافظه تاریخی مردم قدرشناس ایران جاودانه خواهد ماند.

ضمن گرامیداشت مقام والا و خدمات پربرکت آن نیک‌مرد فرهیخته، این ماتم را به خانواده محترم قفلی ، یاران و همراهان ایشان در جامعه خیرین مدرسه‌ساز کشور و همه دوستداران علم و آموزش، صمیمانه تسلیت می‌گویم.

از درگاه خداوند بخشاینده، برای آن مرحوم آرامش ابدی و برای بازماندگان گرامی، بردباری و تندرستی خواستارم.